Les racines de GHM regroupent un même type de prise en charge, défini par les diagnostics et les actes classants réalisés au cours du séjour hospitalier. Elles comportent 5 caractères correspondant :
 les 2 premiers, à la catégorie majeure de diagnostic (28 CMD dont la liste est jointe en annexe),
 le 3ème, au type d’activité : médecine (M), chirurgie ©, interventionnel hors bloc opératoire (K), indifférencié (Z),
 les 2 derniers, à un numéro de référence (numéro d’ordre sans signification).

Elles sont complétées par un 6ème caractère définissant le niveau de sévérité du GHM, de 1 le plus faible à 4 le plus élevé, ou, le cas échéant, sa nature ambulatoire (codé J), ou sa nature de séjour de courte durée (codé T), ou l’absence de niveau de sévérité (Z).