Il existe au moins un centre de référence au sein de chaque inter-région définie pour les schémas interrégionaux d’organisation sanitaire (SIOS). Les neuf centres sont :
| le CHRU de Lille associé au CH de Tourcoing (région Nord Pas-de-Calais) pour l’interrégion Nord-Ouest, regroupant les régions Basse-Normandie, Haute-Normandie, Picardie, Nord-Pas de Calais |
| le CHU de Nancy (région Champagne-Ardenne) pour l’interrégion Est, regroupant les régions Alsace, Bourgogne, Champagne-Ardenne, Franche- Comté, Lorraine |
| le CHU de Tours (région Centre) et le CHU de Rennes (région Bretagne) pour l’interrégion Ouest, regroupant les régions Bretagne, Centre, Pays-de-Loire, Poitou-Charentes |
| les HCL de Lyon (région Rhône-Alpes) pour l’interrégion Sud Est, regroupant les régions Auvergne, Rhône-Alpes |
| l’AP-HM de Marseille (région PACA) pour l’interrégion Sud-Méditerranée, regroupant les régions Corse, Languedoc-Roussillon, PACA |
| le CHU de Toulouse (région Midi-Pyrénées) pour l’interrégion Sud-Ouest, regroupant les régions, Aquitaine, Limousin, Midi-Pyrénées |
| Le GH Diaconesses-Croix Saint Simon et les CHU Raymond Poincaré – Ambroise Paré (Assistance publique – Hôpitaux de Paris) pour la région Ile-de-France |
Ces centres travaillent en collaboration avec leurs centres correspondants et d’autres établissements de santé afin de proposer une prise en charge de qualité de chaque patient au plus proche de son domicile.